Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slfn5Q8CBA2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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