Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek11Q8C0Q4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms