Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdcl3Q8BVF2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdcl3Q8BVF2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdcl3Q8BVF2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdcl3Q8BVF2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdcl3Q8BVF2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdcl3Q8BVF2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdcl3Q8BVF2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms