Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga3Q8BMI3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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