Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms