Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms