Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms