Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtn4rl2Q7M6Z0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms