Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms