Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4Q6P1D7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slx4Q6P1D7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms