Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcbtb1Q6NXM2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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