Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9bQ6EBV9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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