Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms