Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PatjQ63ZW7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms