Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrn1Q61809 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms