Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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AtrxQ61687 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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AtrxQ61687 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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AtrxQ61687 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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AtrxQ61687 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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AtrxQ61687 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrxQ61687 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms