Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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