Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms