Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp7Q60973 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms