Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms