Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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