Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms