Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf40Q3U319 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf40Q3U319 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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