Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Palb2Q3U0P1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms