Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms