Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms