Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms