Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms