Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp39Q3TIX9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp39Q3TIX9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp39Q3TIX9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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