Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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