Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms