Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms