Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nfe2Q07279 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nfe2Q07279 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nfe2Q07279 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nfe2Q07279 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms