Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms