Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnd1Q03719 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms