Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms