Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms