Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms