Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms