Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms