Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4bP68372 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4bP68372 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4bP68372 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4bP68372 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4bP68372 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4bP68372 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4bP68372 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4bP68372 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms