Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb1P63158 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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