Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Setd4P58467 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms