Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms