Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms