Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh1P48985 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms