Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms