Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RxraP28700 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RxraP28700 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms