Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a1P24549 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms