Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms